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Author: mgxd

nipype/interfaces/fsl/dti.py

@@ -171,7 +171,7 @@ class FSLXCommandInputSpec(FSLCommandInputSpec):
         low=0,
         value=0,
         usedefault=True,
-        argstr='--burninnoard=%d',
+        argstr='--burnin_noard=%d',
         desc=('num of burnin jumps before the ard is'
               ' imposed'))
     sample_every = traits.Range(
@@ -424,7 +424,7 @@ class BEDPOSTX5(FSLXCommand):
     >>> bedp = fsl.BEDPOSTX5(bvecs='bvecs', bvals='bvals', dwi='diffusion.nii',
     ...                     mask='mask.nii', n_fibres=1)
     >>> bedp.cmdline
-    'bedpostx bedpostx -b 0 --burninnoard=0 --forcedir -n 1 -j 5000 \
+    'bedpostx bedpostx -b 0 --burnin_noard=0 --forcedir -n 1 -j 5000 \
 -s 1 --updateproposalevery=40'
 
     """

nipype/interfaces/fsl/tests/test_auto_BEDPOSTX5.py

@@ -15,7 +15,7 @@ def test_BEDPOSTX5_inputs():
             usedefault=True,
         ),
         burn_in_no_ard=dict(
-            argstr='--burninnoard=%d',
+            argstr='--burnin_noard=%d',
             usedefault=True,
         ),
         bvals=dict(mandatory=True, ),

nipype/interfaces/fsl/tests/test_auto_FSLXCommand.py

@@ -15,7 +15,7 @@ def test_FSLXCommand_inputs():
             usedefault=True,
         ),
         burn_in_no_ard=dict(
-            argstr='--burninnoard=%d',
+            argstr='--burnin_noard=%d',
             usedefault=True,
         ),
         bvals=dict(

nipype/interfaces/fsl/tests/test_auto_XFibres5.py

@@ -15,7 +15,7 @@ def test_XFibres5_inputs():
             usedefault=True,
         ),
         burn_in_no_ard=dict(
-            argstr='--burninnoard=%d',
+            argstr='--burnin_noard=%d',
             usedefault=True,
         ),
         bvals=dict(